SMA Kristen Pandhega Jaya menerapkan beberapa core value dalam mendidik para siswanya. Melalui value-value ini diharapkan Pandhega Jaya mampu menghasilkan lulusan berkualitas sebagai calon pemimpin bangsa. Value ini tidak hanya di terapkan kepada para murid, namun juga dihidupi oleh para pengajar dan seluruh staf Pandhega Jaya sehingga mampu menjadi teladan bagi para murid. Value tersebut, meliputi :

    1. Fear of God
    2. Servant leadership
    3. Visioner
    4. Citizenship
    5. Innovative
    6. Totality

Sekolah ini mengintegrasikan 4 jenis Kurikulum, yaitu Kurikulum Nasional, Kurikulum Kepemimpinan dari Excellent Leader Training, Kurikulum Entrepreneurship dan Kurikulum Pembelajaran Alkitab. Siswa-siswi dididik untuk melakukan tindakan konkret dalam pengabdian masyarakat dengan menerapkan nilai-nilai kebenaran dan karakter Kristus.