Setelah beberapa bulan belajar secara online, SMAKr. Pandhega Jaya telah mendapatkan izin dari orangtua murid maupun dinas terkait untuk melakukan aktivitas belajar secara normal yakni tatap muka langsung antara guru dan peserta didik. Berada di zona hijau bukan berarti luput dari protokol kesehatan. Para guru, karyawan maupun peserta didik tetap memperhatikan dan mengutamakan kesehatan dengan memakai masker dan mencuci tangan.
Dengan terus mengikuti perkembangan dan berkoordinasi dengan dinas terkait sekolah dapat kembali merubah aturan tatap muka ini apabila dalam perkembangan dalam masyarakat sekitar akibat pandemi Covid-19. Untuk diketahui bahwa sebanyak 81 peserta didik yang berasal dari beberapa daerah di Nusa Tenggara Timur (NTT) telah berada di asrama SMAKr. Pandhega Jaya.